RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 RNF141Q8WVD5 230 aa7.17□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 MSGN1A6NI15 193 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM157AC9JC47 383 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 SSSCA1O60232 199 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 HRASP01112 189 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 IFNA10P01566 189 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARG1P05089 322 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 P2RY1P47900 373 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 HCP5Q6MZN7 132 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 RNF152Q8N8N0 203 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 RPEQ96AT9 228 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 CENPEQ02224 2701 aa7.16□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 LY6LH3BQJ8 138 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 TOX4O94842 621 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGKV1-16P04430 117 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 HKR1P10072 659 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 HTR1DP28221 377 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 MC5RP33032 325 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 VAMP2P63027 116 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 KLRD1Q13241 179 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 AARDQ4LEZ3 155 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM177Q53S58 311 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 SSX9Q7RTT3 188 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAB40CQ96S21 281 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM140Q9NV12 185 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM160Q9NX00 188 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.15□□□□□ -1.26
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 KCNAB3O43448 404 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 SYNGR2O43760 224 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 MED6O75586 246 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 NXPH3O95157 252 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 CEACAM3P40198 252 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 TNFRSF9Q07011 255 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 GPR157Q5UAW9 335 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR4A47Q6IF82 309 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 LHX4Q969G2 390 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 MBD6Q96DN6 1003 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 MALSU1Q96EH3 234 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 HARBI1Q96MB7 349 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 TXN2Q99757 166 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 DPM3Q9P2X0 92 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.15□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 VPS13CQ709C8 3753 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 A4D1N5 150 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 COLCA2A8K830 154 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 CHST1O43916 411 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 GPR137BO60478 399 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR9G9P0C7N8 305 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 TAS2R30P59541 319 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 UBE2KP61086 200 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF429Q86V71 674 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR4A16Q8NH70 328 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 TBX15Q96SF7 602 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 PFDN5Q99471 154 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.14□□□□□ -1.27
PRKAR1A-211ENST00000586397 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms