RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A087WX48 190 aa0.31□□□□□ -2.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C21orf140B9A014 251 aa0.31□□□□□ -2.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 K7ERQ8 282 aa0.31□□□□□ -2.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXCR4P61073 352 aa0.31□□□□□ -2.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf158Q8N1D5 194 aa0.31□□□□□ -2.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBL4BQ8N7F7 174 aa0.31□□□□□ -2.36
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF676Q8N7Q3 588 aa0.31□□□□□ -2.36
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHMP5Q9NZZ3 219 aa0.31□□□□□ -2.36
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 I3L521 148 aa0.26□□□□□ -2.37
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT7P08729 469 aa0.26□□□□□ -2.37
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf194Q5T5A4 169 aa0.26□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AAED1Q7RTV5 226 aa0.26□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5B17Q8NGF7 314 aa0.26□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PATE1Q8WXA2 126 aa0.26□□□□□ -2.37
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHRS9Q9BPW9 319 aa0.26□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AK3Q9UIJ7 227 aa0.26□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAST2Q6P0Q8 1798 aa0.26□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EML5Q05BV3 1969 aa0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COCHO43405 550 aa0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HLA-DRAP01903 254 aa0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BATFQ16520 125 aa0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C5orf46Q6UWT4 87 aa0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM251Q8N6I4 163 aa0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JOSD2Q8TAC2 188 aa0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLK9Q9UKQ9 250 aa0.25□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa0.24□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BIRC5O15392 142 aa0.24□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HYPMO75409 117 aa0.24□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5F1O95221 314 aa0.24□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QAP02745 245 aa0.24□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PET100P0DJ07 73 aa0.24□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 S100A7P31151 101 aa0.24□□□□□ -2.37
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRS3P32247 399 aa0.24□□□□□ -2.37
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