RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SCN1AP35498 2009 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAST1Q9Y2H9 1570 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 UNC80Q8N2C7 3258 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MYO3AQ8NEV4 1616 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RREB1Q92766 1687 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RGPD1P0DJD0 1748 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 FASNP49327 2511 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RALGAPBQ86X10 1494 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CASZ1Q86V15 1759 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATP7AQ04656 1500 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A1B0GV50 99 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 GGTLC3B5MD39 225 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAAHO00519 579 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 LY6HO94772 140 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SOD1P00441 154 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 TTRP02766 147 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 FABP1P07148 127 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC25A16P16260 332 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATP6V0CP27449 155 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPL5P46777 297 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM42Q69YG0 159 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 C20orf196Q8IYI0 205 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC22A24Q8N4F4 322 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPRMLQ8N4K4 120 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF676Q8N7Q3 588 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR11H1Q8NG94 326 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR10A6Q8NH74 314 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 BTF3L4Q96K17 158 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MGLLQ99685 303 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIFC1Q9BW19 673 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 C11orf1Q9H5F2 150 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 C16orf95Q9H693 158 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ENY2Q9NPA8 101 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 UQCC1Q9NVA1 299 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF391Q9UJN7 358 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 R4GN34 69 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLXNC1O60486 1568 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ROCK1Q13464 1354 aa2.34□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa2.34□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 BDP1A6H8Y1 2624 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DIP2AQ14689 1571 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 UGGT1Q9NYU2 1555 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DEPDC5O75140 1603 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 C9JCJ5 164 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 C15orf65H3BRN8 121 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 HLA-DRB1P01911 266 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCL3P10147 92 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 NPPCP23582 126 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 IL15RAQ13261 267 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF141Q15928 474 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LCE1CQ5T751 118 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MSRB3Q8IXL7 192 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q8NAQ8 132 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 UPK3BQ9BT76 320 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DUSP21Q9H596 190 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 TAAR3PQ9P1P4 343 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 OPTCQ9UBM4 332 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRELID1Q9Y255 219 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 CEP152O94986 1710 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAGI2Q86UL8 1455 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 NEO1Q92859 1461 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPR179Q6PRD1 2367 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 EFCAB6Q5THR3 1501 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 DLC1Q96QB1 1528 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 KDM5DQ9BY66 1539 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 E9PCH4 1651 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP9-201ENST00000417027 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.6 ms