RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMPX	Q9UHP9	88 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF735	P0CB33	412 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZBTB25	P24278	435 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	CAPG	P40121	348 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP10-1	P60331	282 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMED1	Q13445	227 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLK9	Q2XQG4	91 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR148	Q8TDV2	347 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	THTPA	Q9BU02	230 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC42	Q9Y546	428 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651		J3QRK9	145 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	SOCS1	O15524	211 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIMS3	P0CW19	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIMS4	P0CW20	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAS1L	P35410	378 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	EMP1	P54849	157 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR176	Q14439	515 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDK10	Q15131	360 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGSF11	Q5DX21	431 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	MMD2	Q8IY49	270 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYS1	Q8N2H4	156 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	FRZB	Q92765	325 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASB9	Q96DX5	294 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	NRBF2	Q96F24	287 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q9N2K0	584 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	DPPA5	A6NC42	116 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	AQP12B	A6NM10	295 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	CD2	P06729	351 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAP2K4	P45985	399 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	UNC119	Q13432	240 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	RTL8B	Q17RB0	113 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q6ZSN1	163 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPATA24	Q86W54	205 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	RFK	Q969G6	155 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	BET1	O15155	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	FCGR3B	O75015	233 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACTL6B	O94805	426 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	GSTT2	P0CG29	244 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	GSTT2B	P0CG30	244 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSMD7	P51665	324 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM50B	P56557	158 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF151	Q2KHN1	245 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCF24	Q7RTU0	167 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	STH	Q8IWL8	128 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	ST8SIA2	Q92186	375 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	GGH	Q92820	318 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR51E2	Q9H255	320 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		6.04	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651		G3V2T6	193 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	DFFB	O76075	338 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	DEFA4	P12838	97 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	GABRB1	P18505	474 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	6.03	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	ETV1	P50549	477 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	QRFP	P83859	136 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	INSL4	Q14641	139 aa		6.03	□□□□□ -1.44
NIF3L1-206	ENST00000416651	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44

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