RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613049.4

RGS3-231, Transcript of regulator of G protein signaling 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RGS3, Length 1,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGS3-231	ENST00000613049	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TCF19	Q9Y242	345 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049		H7C2Y5	167 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	LIPF	P07098	398 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	PRRX1	P54821	245 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TMEM177	Q53S58	311 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	BET1L	Q9NYM9	111 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TMEM218	A2RU14	115 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	C15orf62	A8K5M9	175 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	CDKN1A	P38936	164 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	REG1B	P48304	166 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	RAB13	P51153	203 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	LFNG	Q8NES3	379 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	RFNG	Q9Y644	331 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049		J3QKU1	62 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	UPK2	O00526	184 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	LHX4	Q969G2	390 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	HARBI1	Q96MB7	349 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TREM1	Q9NP99	234 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	AGPAT2	O15120	278 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	IFNA10	P01566	189 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	MC5R	P33032	325 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	EFNA4	P52798	201 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	SERF2	P84101	59 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	VWC2	Q2TAL6	325 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	RSG1	Q9BU20	258 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	ENY2	Q9NPA8	101 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	IGLV1-47	P01700	117 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	SNCA	P37840	140 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TLE4	Q04727	773 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	AKR1C1	Q04828	323 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	BTBD17	A6NE02	478 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	C22orf46	C9J442	243 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	KBTBD11	O94819	623 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	RNF224	P0DH78	156 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	OR4A5	Q8NH83	315 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	APOC3	P02656	99 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	CD5	P06127	495 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	RAB11A	P62491	216 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	15.15	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	OR5B3	Q8NH48	314 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	GGACT	Q9BVM4	153 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RGS3-231	ENST00000613049	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	PRCD	Q00LT1	54 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049		M0R1W7	72 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	HBE1	P02100	147 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	RAB2A	P61019	212 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RGS3-231	ENST00000613049	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		15.14	■□□□□ 0.01

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