RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	AKR1C4	P17516	323 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	G6PC	P35575	357 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	CCR6	P51684	374 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	NDP	Q00604	133 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM16L	Q309B1	348 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	SP6	Q3SY56	376 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	OR4A5	Q8NH83	315 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	TP53RK	Q96S44	253 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	BET1L	Q9NYM9	111 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1W2PN81	502 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	B3GALNT1	O75752	331 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	CHRNA7	P36544	502 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	POU2AF1	Q16633	256 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	TEX38	Q6PEX7	206 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	COMMD1	Q8N668	190 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	UPK2	O00526	184 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	LYRM1	O43325	122 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	SNAPC5	O75971	98 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	ATG12	O94817	140 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	OPN1MW	P04001	364 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	OR5AC1	P0C628	307 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	MAS1L	P35410	378 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	DHODH	Q02127	395 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF580	Q9UK33	172 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019		A0A1W2PRX2	142 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	PLA2G10	O15496	165 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	NDUFB6	O95139	128 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	IGKV1-39	P01597	117 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	IGKV1D-39	P04432	117 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	APELA	P0DMC3	54 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	PF4V1	P10720	104 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	ANXA3	P12429	323 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	HLA-G	P17693	338 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	UCP1	P25874	307 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	AKR1C2	P52895	323 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	CFHR3	Q02985	330 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM230	Q96A57	120 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	UPK1B	O75841	260 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	IGHG4	P01861	327 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	ELANE	P08246	267 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	MYOD1	P15172	320 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	BTC	P35070	178 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	CD83	Q01151	205 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	FOXE3	Q13461	319 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	OR5T1	Q8NG75	326 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	OR4A16	Q8NH70	328 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	SEC22A	Q96IW7	307 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM68	Q96MH6	324 aa		9.99	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms