RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MFSD2BA6NFX1 497 aa12.04□□□□□ -0.48
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF735P0CB33 412 aa12.04□□□□□ -0.48
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR51E2Q9H255 320 aa12.04□□□□□ -0.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HERC1Q15751 4861 aa12.03□□□□□ -0.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.03□□□□□ -0.48
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOCS1O15524 211 aa12.02□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FABP7O15540 132 aa12.02□□□□□ -0.49
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF124Q15973 351 aa12.01□□□□□ -0.49
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7EMT4 169 aa12□□□□□ -0.49
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CELP19835 753 aa12□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 50.1
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZR54 194 aa12□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa12□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APH1BQ8WW43 257 aa12□□□□□ -0.49
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.99□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa11.99□□□□□ -0.49
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 GINS4Q9BRT9 223 aa11.99□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CENPOQ9BU64 300 aa11.99□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNK15Q9H427 330 aa11.99□□□□□ -0.49
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa11.98□□□□□ -0.49
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYB5BO43169 146 aa11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNA21P01568 189 aa11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNA17P01571 189 aa11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM50BP56557 158 aa11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCTD9Q7L273 389 aa11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.98□□□□□ -0.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.98□□□□□ -0.49
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