RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 OR9G1Q8NH87 305 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SSX3Q99909 188 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CHIAQ9BZP6 476 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 Q9N2K0 584 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 PSG11Q9UQ72 335 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM235A6NFC5 223 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 C15orf65H3BRN8 121 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 MFNGO00587 321 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SLC31A2O15432 143 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 GPR137BO60478 399 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CA11O75493 328 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 GABARAPO95166 117 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 NAPSAO96009 420 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 GLAP06280 429 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CGB3P0DN86 165 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CGB7P0DN87 165 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 PTHLHP12272 177 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 AZU1P20160 251 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 GZMHP20718 246 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CD24P25063 80 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 TALDO1P37837 337 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 IER3P46695 156 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 PRRX1P54821 245 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 GNG2P59768 71 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 HLA-DRB3P79483 266 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 DLK1P80370 383 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 PAX5Q02548 391 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CDNFQ49AH0 187 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF596Q8TC21 504 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM158Q8WZ71 300 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 TOMM40LQ969M1 308 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 C5orf30Q96GV9 206 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 VGLL1Q99990 258 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 RAB9BQ9NP90 201 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ABRACLQ9P1F3 81 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ETV7Q9Y603 341 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 C5orf51A6NDU8 294 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 C15orf62A8K5M9 175 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 LEUTXA8MZ59 168 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 FAM25AB3EWG3 89 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 FAM25CB3EWG5 89 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 FAM25GB3EWG6 89 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 TRDCB7Z8K6 153 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 J3QRK9 145 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 HSD17B6O14756 317 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 BET1O15155 118 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CHST1O43916 411 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 HPGDSO60760 199 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 PRAF2O60831 178 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 IGLV1-47P01700 117 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CRYBA1P05813 215 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms