RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557496.1

FOXN3-216, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 228 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-216ENST00000557496 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TMEM42Q69YG0 159 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SPATA24Q86W54 205 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 C10orf67Q8IYJ2 551 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 DYNAPQ8N1N2 210 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ZNF565Q8N9K5 539 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OR5B17Q8NGF7 314 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 OR5K1Q8NHB7 308 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 LHFPL5Q8TAF8 219 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RAB2BQ8WUD1 216 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MITD1Q8WV92 249 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RORBQ92753 470 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GTF2H4Q92759 462 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CCDC127Q96BQ5 260 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SERPINB11Q96P15 392 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HBEGFQ99075 208 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ACBD6Q9BR61 282 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MND1Q9BWT6 205 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 BCL2L14Q9BZR8 327 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MS4A12Q9NXJ0 267 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TAAR3PQ9P1P4 343 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TP73-AS1Q9UF72 201 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NAT8Q9UHE5 227 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ZFP30Q9Y2G7 519 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 FIS1Q9Y3D6 152 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TIMM22Q9Y584 194 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ALG5Q9Y673 324 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 FLT4P35916 1363 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 KIAA0232Q92628 1395 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 KIF13BQ9NQT8 1826 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.08□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 PEAK1Q9H792 1746 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 A0A0J9YW62 118 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RAB19A4D1S5 217 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GRIFINA4D1Z8 144 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MKRN2OSH3BPM6 223 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GOLGA8RI6L899 631 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NDUFS8O00217 210 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 LST1O00453 97 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 COX7A2LO14548 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 UBE2L6O14933 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 LEPROTO15243 131 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SYNGR1O43759 233 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 KLRC4O43908 158 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NDUFB2O95178 105 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 PSMG1O95456 288 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SNAP29O95721 258 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NPPAP01160 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NPYP01303 97 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HLA-DQB2P05538 268 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ASAH2BP0C7U1 165 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TRGC1P0CF51 173 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 UBBP0CG47 229 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CRYGAP11844 174 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 NQO2P16083 231 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 PTMSP20962 102 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 CALRP27797 417 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 HLA-DMBP28068 263 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 MIPP30301 263 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 AGTR1P30556 359 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RCVRNP35243 200 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 REG1BP48304 166 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 DLX6P56179 175 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TAS2R45P59539 299 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TPI1P60174 286 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SNAP25P60880 206 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 DSTNP60981 165 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RAB4BP61018 213 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 DAD1P61803 113 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TBPL1P62380 186 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 VSNL1P62760 191 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RPS24P62847 133 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 RPL30P62888 115 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TNNC1P63316 161 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 SLAMF1Q13291 335 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 FLOT2Q14254 428 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 GNA13Q14344 377 aa-0.09□□□□□ -2.42
FOXN3-216ENST00000557496 ZNF345Q14585 488 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.7 ms