RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 JPT1Q9UK76 154 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 PRB1P04280 392 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SFTA3P0C7M3 94 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ARF6P62330 175 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 OR5T1Q8NG75 326 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 FAM122AQ96E09 287 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 IFI27L2Q9H2X8 130 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ENY2Q9NPA8 101 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 CTSZQ9UBR2 303 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 GUK1Q16774 197 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 MST1LQ2TV78 715 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF709Q8N972 641 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM140Q9NV12 185 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 FAM74A7A6NL05 159 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ATG12O94817 140 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 HTD2P86397 168 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ATP5SQ99766 215 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 MMP26Q9NRE1 261 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 GNB1P62873 340 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SLC25A22Q9H936 323 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 B9A039 149 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 YPEL1O60688 119 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SOD3P08294 240 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 NQO2P16083 231 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 CTRB1P17538 263 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 FGF7P21781 194 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ODF3L1Q8IXM7 274 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF383Q8NA42 475 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 YPEL2Q96QA6 119 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 FGF16O43320 207 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SEC11BP0C7V7 166 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SPP1P10451 314 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 CFHR2P36980 270 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 GATA4P43694 442 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 MOB3BQ86TA1 216 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 IL22RA2Q969J5 263 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 RPRMQ9NS64 109 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 JKAMPQ9P055 326 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 HPRT1P00492 218 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 DANCRP0C864 163 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 TCF23Q7RTU1 214 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 RRHO14718 337 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 PITX3O75364 302 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 DFFBO76075 338 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 REG1AP05451 166 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 OR8U8P0C7N1 319 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SNCAP37840 140 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 TFF3Q07654 80 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 ADCYAP1P18509 176 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 NPBWR1P48145 328 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 MLANAQ16655 118 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 OR4S2Q8NH73 311 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 HARBI1Q96MB7 349 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-216ENST00000524481 RAB7AP51149 207 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-216ENST00000524481 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-216ENST00000524481 OR4A47Q6IF82 309 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-216ENST00000524481 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRK-216ENST00000524481 Q8TCH9 128 aa9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms