RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACSM3Q53FZ2 586 aa0.46□□□□□ -2.34
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa0.46□□□□□ -2.34
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHGR1C9JFL3 82 aa0.45□□□□□ -2.34
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAT8Q9UHE5 227 aa0.4□□□□□ -2.35
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALPK2Q86TB3 2170 aa0.39□□□□□ -2.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 REG1BP48304 166 aa0.39□□□□□ -2.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HLA-DRB3P79483 266 aa0.39□□□□□ -2.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EBPQ15125 230 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDK10Q15131 360 aa0.39□□□□□ -2.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9orf64Q5T6V5 341 aa0.39□□□□□ -2.35
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MED10Q9BTT4 135 aa0.39□□□□□ -2.35
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF24Q5T7B8 1368 aa0.39□□□□□ -2.35
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