RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153		Q8N9W7	124 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	KIAA1456	Q9P272	454 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	RRH	O14718	337 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	KRAS	P01116	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	AMY1A	P04745	511 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	OR4E1	P0C645	316 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	G6PC	P35575	357 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	LGALS7	P47929	136 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TAS2R31	P59538	309 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	DHODH	Q02127	395 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153		Q6ZS46	218 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	NPB	Q8NG41	125 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	RNF5	Q99942	180 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	C1RL	Q9NZP8	487 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	NDUFA3	O95167	84 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	UCP1	P25874	307 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM187	Q14656	261 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	C4orf46	Q504U0	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	GALNT14	Q96FL9	552 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	RHOV	Q96L33	236 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	ATR	Q13535	2644 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	FCN1	O00602	326 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	FGF16	O43320	207 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	SFT2D2	O95562	160 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	PTTG1	O95997	202 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	HRAS	P01112	189 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	CRYBA1	P05813	215 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	ANXA3	P12429	323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	NQO2	P16083	231 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	RELB	Q01201	579 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	SPDEF	O95238	335 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	UBE2K	P61086	200 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	DHRS2	Q13268	280 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	RGS21	Q2M5E4	152 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	COMMD9	Q9P000	198 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153		M0QZK8	103 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	CDS2	O95674	445 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	CRYGB	P07316	175 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	AKR1C2	P52895	323 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	ERVK-16	P61578	105 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153		Q6ZSV7	163 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	LYG2	Q86SG7	212 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	SEC22A	Q96IW7	307 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	NSG2	Q9Y328	171 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SUMO3-206	ENST00000479153	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74

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