RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 TNFSF13O75888 250 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 OR4A8P0C604 315 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 CXCL3P19876 107 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 TSPOP30536 169 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM54Q969K7 222 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 C9orf85Q96MD7 179 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 OR4C12Q96R67 309 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRC61Q9BV99 259 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ASF1BQ9NVP2 202 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 PARP14Q460N5 1801 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 K7EMT4 169 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 CDC42EP2O14613 210 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ZFAND5O76080 213 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 LYPD3O95274 346 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 GPX1P07203 203 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 KLK2P20151 261 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 GPD1P21695 349 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 OR10J1P30954 320 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 MARCKSL1P49006 195 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 MYL5Q02045 173 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM27E3Q08E93 113 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 OPCMLQ14982 345 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 CR1LQ2VPA4 569 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF695Q8IW36 515 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 TFAP2CQ92754 450 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM18Q96B42 140 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 SELENOIQ9C0D9 397 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 NRN1Q9NPD7 142 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 EHFQ9NZC4 300 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 VAX2Q9UIW0 290 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 AKAP9Q99996 3911 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 MYH4Q9Y623 1939 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 RYR3Q15413 4870 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 MEIS3P1A6NDR6 274 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 B4DEV8 164 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 EDIL3O43854 480 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 FGF17O60258 216 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF883P0CG24 379 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 LINC00694P0DN24 101 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 CPMP14384 443 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 FABP4P15090 132 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 GPM6AP51674 278 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 RND3P61587 244 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 LAGE3Q14657 143 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRC10Q5BKY1 277 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 OR52R1Q8NGF1 315 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 OR2T27Q8NH04 317 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 OR10D3Q8NH80 312 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ARPC1AQ92747 370 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 EMC6Q9BV81 110 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 RERGLQ9H628 205 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 MED31Q9Y3C7 131 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ATMQ13315 3056 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 NUP205Q92621 2012 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 NPFFO15130 113 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 SPRY3O43610 288 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 GPR137BO60478 399 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 CD14P08571 375 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 IGLC1P0CG04 106 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 FABP6P51161 128 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 TPPP2P59282 170 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 OLFML2AQ68BL7 652 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 Q6ZVH6 145 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 STPG4Q8N801 248 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 Q8TCH9 128 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 RARRES2Q99969 163 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-208ENST00000474246 KXD1Q9BQD3 176 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.8 ms