RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	AADAC	P22760	399 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	CDK10	Q15131	360 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SSR3	Q9UNL2	185 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TEX22	C9J3V5	150 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	FCGR3B	O75015	233 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SCGN	O76038	276 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	PRH1	P02810	166 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	CTXN2	P0C2S0	81 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ZP3	P21754	424 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SCAND1	P57086	179 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SYNJ2BP	P57105	145 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	MXD1	Q05195	221 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	KCTD9	Q7L273	389 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	USMG5	Q96IX5	58 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4C12	Q96R67	309 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464		Q9H521	79 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	COA4	Q9NYJ1	87 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		9.12	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464		E7EUB6	86 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	BMPR1B	O00238	502 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC22A5	O76082	557 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	CSN3	P07498	182 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	PTHLH	P12272	177 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	GNG2	P59768	71 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SNAPC3	Q92966	411 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	RCHY1	Q96PM5	261 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	GPHA2	Q96T91	129 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ETV7	Q9Y603	341 aa		9.11	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM223B	A6NKX1	122 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464		A8MZ25	164 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	CD36	P16671	472 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TGFBR1	P36897	503 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	RHOG	P84095	191 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	KLK9	Q2XQG4	91 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	HOGA1	Q86XE5	327 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	MMD2	Q8IY49	270 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	BEST4	Q8NFU0	473 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	PHB2	Q99623	299 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SPIN2A	Q99865	258 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		9.1	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A0A6YYH2	397 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	HMX3	A6NHT5	357 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464		A6NJ64	397 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	CGB1	A6NKQ9	187 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	KBTBD11	O94819	623 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	MSMO1	Q15800	293 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	NEDD8	Q15843	81 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	IDNK	Q5T6J7	187 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	MFSD4A	Q8N468	514 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4S2	Q8NH73	311 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SPATA2	Q9UM82	520 aa		9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PTPRF-211	ENST00000467464	C3orf84	H3BNL1	204 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PTPRF-211	ENST00000467464	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2A4	O95047	310 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF735	P0CB33	412 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PTPRF-211	ENST00000467464	MYOD1	P15172	320 aa		9.08	□□□□□ -0.96
PTPRF-211	ENST00000467464	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		9.08	□□□□□ -0.96

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