RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 VSIG4Q9Y279 399 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CTDSP2O14595 271 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 WIPF1O43516 503 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 GNRHRP30968 328 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 HRH1P35367 487 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS8Q16651 343 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB136Q30KP8 78 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM17Q86X19 198 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5M8Q8NGP6 311 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6F1Q8NGZ6 308 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4S2Q8NH73 311 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MIXL1Q9H2W2 232 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS5O15539 181 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TPPPO94811 219 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CD40LGP29965 261 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5T1Q8NG75 326 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MS4A10Q96PG2 267 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ABHD1Q96SE0 405 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 GNB4Q9HAV0 340 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SCOCQ9UIL1 159 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 NOTCH1P46531 2555 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MSGN1A6NI15 193 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 RCVRNP35243 200 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 KIR2DS2P43631 304 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MOB3AQ96BX8 217 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM68Q96MH6 324 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5B12Q96R08 314 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 I3L521 148 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 NOL3O60936 208 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPAN5P62079 268 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TNXAQ16473 311 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 OR11H1Q8NG94 326 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 C15orf40Q8WUR7 153 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 BORCS5Q969J3 196 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 KLK11Q9UBX7 282 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PLXNB1O43157 2135 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4-204ENST00000416021 NOTCH3Q9UM47 2321 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BMQ9 156 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 RAMP3O60896 148 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2A4O95047 310 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 HRASP01112 189 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB25P57735 213 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 RUNX1Q01196 453 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 CATR1Q13166 79 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ASPHD1Q5U4P2 390 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 LAX1Q8IWV1 398 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 OR1N2Q8NGR9 330 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 OR52I2Q8NH67 350 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ISOC1Q96CN7 298 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2A7Q96R45 310 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PHB2Q99623 299 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 CEPT1Q9Y6K0 416 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ACTL6BO94805 426 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 MMD2Q8IY49 270 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 VSTM2AQ8TAG5 236 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 SLA2Q9H6Q3 261 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 16.6
SH3BP4-204ENST00000416021 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TRGV3P03979 118 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TPPP2P59282 170 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 AADACL3Q5VUY0 350 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 SSX9Q7RTT3 188 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 POC5Q8NA72 575 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 OR51H1Q8NH63 302 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 RHOVQ96L33 236 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BUA1 57 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 M0QYG6 137 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 HPRT1P00492 218 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 APELAP0DMC3 54 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 VAX1Q5SQQ9 334 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 LPCAT3Q6P1A2 487 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 CMTM1Q8IZ96 169 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 DPF1Q92782 380 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 FXYD6Q9H0Q3 95 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
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