RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 DSCAMO60469 2012 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 TGOLN2O43493 480 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 IGKV1D-33P01593 117 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 IGKV1-33P01594 117 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 FGF7P21781 194 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CD40P25942 277 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 Q8NA96 180 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 GCM1Q9NP62 436 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 RNF7Q9UBF6 113 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 IGHV1-46P01743 117 aa14.58□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 ACSM6Q6P461 480 aa14.58□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.58□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM242Q9NWH2 141 aa14.58□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 A0A0G2JNJ9 132 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 IFITM10A6NMD0 228 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 SLC31A2O15432 143 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H2BKO60814 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 IFNA1P01562 189 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H2BJP06899 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H2BOP23527 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H2BBP33778 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 PLA2G5P39877 138 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H2BDP58876 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H2BCP62807 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 FOXC1Q12948 553 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 UTF1Q5T230 341 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 LEAP2Q969E1 77 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 LHX4Q969G2 390 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 P2RX4Q99571 388 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 Q9UFV3 132 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 IL19Q9UHD0 177 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 CGB3P0DN86 165 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 CGB7P0DN87 165 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 TFF3Q07654 80 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 FAM222BQ8WU58 562 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 S1PR3Q99500 378 aa14.57□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 PPP1R2P9O14990 202 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 RND2P52198 227 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 GNB2P62879 340 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 OR4A16Q8NH70 328 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 Q8TCH9 128 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 FAM210BQ96KR6 192 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 VAX2Q9UIW0 290 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 C15orf62A8K5M9 175 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 CLDN34H7C241 214 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 PRRG2O14669 202 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 ERVK-16P61578 105 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 VWC2Q2TAL6 325 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 SLC25A22Q9H936 323 aa14.56□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 MBP02144 154 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 TRGC2P03986 189 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 TNFSF4P23510 183 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 PYY3Q5JQD4 70 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 STUMQ69YW2 141 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF709Q8N972 641 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 SDSLQ96GA7 329 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.55□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 RAB7AP51149 207 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 AARDQ4LEZ3 155 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS1-202ENST00000323081 CCL13Q99616 98 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.3 ms