RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	UBXN1	Q04323	297 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		13.27	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP2K2	P36507	400 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC77	Q9BR77	488 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	STIM2	Q9P246	746 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	LRMP	Q12912	555 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CNGA4	Q8IV77	575 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.26	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	ASIC1	P78348	528 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC25	Q86WR0	208 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC14	Q96N46	770 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CLGN	O14967	610 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	WTAP	Q15007	396 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PCK1	P35558	622 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	POTED	Q86YR6	584 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	VAMP4	O75379	141 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	ACTN2	P35609	894 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	NSD2	O96028	1365 aa		13.24	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	BMP15	O95972	392 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	FANCC	Q00597	558 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	DAAM2	Q86T65	1068 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	RTN1	Q16799	776 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PIK3R4	Q99570	1358 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	GPT	P24298	496 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	DLC1	Q96QB1	1528 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	VPS16	Q9H269	839 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	STARD3NL	O95772	234 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.22	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	RXRA	P19793	462 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	TNNC1	P63316	161 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PSMB7	Q99436	277 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		13.21	□□□□□ -0.29
FAM200B-223	ENST00000622362	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3

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