RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477		H7C1D1	291 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	TRAF5	O00463	557 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	WNT10B	O00744	389 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	NEFL	P07196	543 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	DPF2	Q92785	391 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.35	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.35	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.35	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	GOLIM4	O00461	696 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	CRK	P46108	304 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
MLH1-222	ENST00000539477	TOMM70	O94826	608 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	MECOM	Q03112	1051 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	HTT	P42858	3142 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	MX1	P20591	662 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.33	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	PDE4A	P27815	886 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	AAMP	Q13685	434 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	LDHD	Q86WU2	507 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SEMA3E	O15041	775 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	NUCB1	Q02818	461 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		11.32	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SLURP2	P0DP57	97 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	MYH1	P12882	1939 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.31	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ATP5J	P18859	108 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	PDE1A	P54750	535 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	TCP10	Q12799	353 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	NFIA	Q12857	509 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	PRKG1	Q13976	671 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	HAUS7	Q99871	368 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.3	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	BTD	P43251	543 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		11.29	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	PICALM	Q13492	652 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6

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