RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502394.1

MATR3-231, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 589 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-231	ENST00000502394	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	IGSF3	O75054	1194 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	ADD2	P35612	726 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	WASHC4	Q2M389	1173 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	MYH7	P12883	1935 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	CHD4	Q14839	1912 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	RIMBP2	O15034	1052 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	UBE3C	Q15386	1083 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	VPS33B	Q9H267	617 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	COL4A5	P29400	1685 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	PDE6A	P16499	860 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	IER5L	Q5T953	404 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF384	Q8TF68	577 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	OSBP2	Q969R2	916 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	USP26	Q9BXU7	913 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	NFKBIE	O00221	500 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	REC8	O95072	547 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	PSEN1	P49768	467 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	MAP3K12	Q12852	859 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	AOC3	Q16853	763 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	PODN	Q7Z5L7	613 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	APPBP2	Q92624	585 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	MAST3	O60307	1309 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MATR3-231	ENST00000502394	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	PRDX5	P30044	214 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	DOK7	Q18PE1	504 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	SYT17	Q9BSW7	474 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	BCS1L	Q9Y276	419 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	SCN9A	Q15858	1988 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394		M0R2C6	588 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	PPIP5K2	O43314	1243 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	ECE2	O60344	883 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	GRIK5	Q16478	980 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	ABCF2	Q9UG63	623 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		14.63	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	YDJC	A8MPS7	323 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	POTEJ	P0CG39	1038 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	IL17RA	Q96F46	866 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	JAG2	Q9Y219	1238 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	PSME4	Q14997	1843 aa		14.62	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	FOXP2	O15409	715 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	GTF2I	P78347	998 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	MECOM	Q03112	1051 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	PTH1R	Q03431	593 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	CERS5	Q8N5B7	392 aa		14.61	□□□□□ -0.07
MATR3-231	ENST00000502394	MAP4K1	Q92918	833 aa		14.61	□□□□□ -0.07

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