RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 VAMP1P23763 118 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 NLRP12P59046 1061 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 DCAF5Q96JK2 942 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 ADAM11O75078 769 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 APBA3O96018 575 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 SELPP16109 830 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 SV2BQ7L1I2 683 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 BACH2Q9BYV9 841 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 KRBA1A5PL33 1030 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 ENC1O14682 589 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 CYP11A1P05108 521 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 NACC1Q96RE7 527 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-215ENST00000498284 C9orf172C9J069 976 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 RECKO95980 971 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 CELA3AP09093 270 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 AP3B2Q13367 1082 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 USP26Q9BXU7 913 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 USP21Q9UK80 565 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 PAGE1O75459 146 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 WISP1O95388 367 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 NME2P22392 152 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 MAOBP27338 520 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 POU4F3Q15319 338 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 SULF2Q8IWU5 870 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 SAMM50Q9Y512 469 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 IGHA1P01876 353 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ITGB2P05107 769 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ARNTP27540 789 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ACAD11Q709F0 780 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 STK35Q8TDR2 534 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 CORO1BQ9BR76 489 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ECEL1O95672 775 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 BMP6P22004 513 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 E9PSI1 815 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 F8W735 103 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 DLGAP3O95886 979 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 CTSBP07858 339 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 CHRNA4P43681 627 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 MAP3K11Q16584 847 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 PDZD3Q86UT5 571 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 CD163Q86VB7 1156 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 CBX8Q9HC52 389 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ALX3O95076 343 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 RLBP1P12271 317 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF76P36508 570 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ADGRE1Q14246 886 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 MBTPS1Q14703 1052 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 KCNB2Q92953 911 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 RNF208Q9H0X6 261 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 MEGF11A6BM72 1044 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 NOS3P29474 1203 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 LIG3P49916 1009 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 FANCCQ00597 558 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 PDE3AQ14432 1141 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC14Q15048 493 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 RASIP1Q5U651 963 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 GGT7Q9UJ14 662 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-215ENST00000498284 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-215ENST00000498284 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.2 ms