RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	WEE1	P30291	646 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	BNIP3	Q12983	259 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	KRT1	P04264	644 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	HOXA5	P20719	270 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUM3-204	ENST00000490444	NFIB	O00712	420 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	ARL4D	P49703	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	MAP7	Q14244	749 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	DRD2	P14416	443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	OCLN	Q16625	522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	CEP120	Q8N960	986 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SCNN1A	P37088	669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	COX20	Q5RI15	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	NFIC	P08651	508 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	PRMT3	O60678	531 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	DLGAP3	O95886	979 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SYN1	P17600	705 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SSFA2	P28290	1259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	KCNA10	Q16322	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	GGN	Q86UU5	652 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PUM3-204	ENST00000490444	ADH5	P11766	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	GLI1	P08151	1106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	CD96	P40200	585 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	NFKBIE	O00221	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM3-204	ENST00000490444	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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