RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 AIDAQ96BJ3 306 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 NEK1Q96PY6 1258 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 DTNBO60941 627 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 UFL1O94874 794 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 LARGE1O95461 756 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 ARMT1Q9H993 441 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT4-205ENST00000489835 DOCK2Q92608 1830 aa20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 MBD4O95243 580 aa20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 RPS6KB1P23443 525 aa20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.52■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CYP7A1P22680 504 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF445P59923 1031 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 KRT32Q14532 448 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 POLLQ9UGP5 575 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 GGA1Q9UJY5 639 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 E7EWF7 191 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PDE6BP35913 854 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CUL4AQ13619 759 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PKP1Q13835 747 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PRKAB2O43741 272 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LCORLQ8N3X6 602 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 C6orf229H3BNL8 230 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NPR1P16066 1061 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF384Q8TF68 577 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PRDX5P30044 214 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CHST3Q7LGC8 479 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 SEMA3EO15041 775 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ATP2B4P23634 1241 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.48■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TPM2P07951 284 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CHRNA5P30532 468 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ME3Q16798 604 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 Q6ZUG5 572 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 SP8Q8IXZ3 490 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NECAB1Q8N987 351 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF213O14771 459 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 RIMBP2O15034 1052 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 MASTLQ96GX5 879 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 MECOMQ03112 1051 aa20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.45■□□□□ 0.87
PRRT4-205ENST00000489835 LAMA4Q16363 1823 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ALDH1B1P30837 517 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 STK3Q13188 491 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 NBPF3Q9H094 633 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 CD209Q9NNX6 404 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 GRIK5Q16478 980 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 INCENPQ9NQS7 918 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 CACNA1SQ13698 1873 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 H0YIN7 160 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 FGD1P98174 961 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ST3GAL1Q11201 340 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 NAPBQ9H115 298 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 RBSNQ9H1K0 784 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 MPNDQ8N594 471 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms