RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482110.5

PBX1-208, Transcript of PBX homeobox 1, human

TSL 5

Gene PBX1, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PBX1-208	ENST00000482110	GRIK5	Q16478	980 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	TEKT1	Q969V4	418 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	NF2	P35240	595 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	HUNK	P57058	714 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	TNNI3K	Q59H18	835 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	TNFAIP1	Q13829	316 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	RASGRF1	Q13972	1273 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.7	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	PRDX5	P30044	214 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	AOX1	Q06278	1338 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	TNNI2	P48788	182 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	RGMB	Q6NW40	437 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	SPATA5	Q8NB90	893 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	GRM1	Q13255	1194 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PBX1-208	ENST00000482110	PCNT	O95613	3336 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	MAP2K2	P36507	400 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	RASA3	Q14644	834 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	SLF2	Q8IX21	1173 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	CCDC102A	Q96A19	550 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	ABCF2	Q9UG63	623 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	MCAM	P43121	646 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	NOG	Q13253	232 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	AACS	Q86V21	672 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	PI16	Q6UXB8	463 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	FAM83A	Q86UY5	434 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	GAK	O14976	1311 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PBX1-208	ENST00000482110	IGSF3	O75054	1194 aa		27.57	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	AOC2	O75106	756 aa		27.57	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	SLC10A3	P09131	477 aa		27.57	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	MAP3K11	Q16584	847 aa		27.57	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	MOB2	Q70IA6	237 aa		27.57	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		27.56	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	GSTO1	P78417	241 aa		27.56	■■■□□ 2
PBX1-208	ENST00000482110	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2

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