RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.62■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.61■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 TEKT1Q969V4 418 aa25.61■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.61■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.6■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 CLRN2A0PK11 232 aa25.6■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.6■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.6■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.6■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.59■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 VEZTQ9HBM0 779 aa25.59■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 PRDX5P30044 214 aa25.58■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 JMYQ8N9B5 988 aa25.58■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 AOX1Q06278 1338 aa25.58■■□□□ 1.69
NELFE-208ENST00000481121 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.58■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.57■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.56■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 VEGFBP49765 207 aa25.56■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.56■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.56■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.56■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.56■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 NF2P35240 595 aa25.55■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 HUNKP57058 714 aa25.55■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 SPATA5Q8NB90 893 aa25.55■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.55■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 MRIQ9BWK5 157 aa25.55■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.55■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.55■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 ABCF2Q9UG63 623 aa25.55■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.54■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.54■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.54■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.54■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 APBB1O00213 710 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 ECE1P42892 770 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 MCAMP43121 646 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 GRM1Q13255 1194 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 TNFAIP1Q13829 316 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 PI16Q6UXB8 463 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 CAPNS2Q96L46 248 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 FKBP1BP68106 108 aa25.52■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 AACSQ86V21 672 aa25.52■■□□□ 1.68
NELFE-208ENST00000481121 DOCK2Q92608 1830 aa25.51■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 RAB11FIP3O75154 756 aa25.51■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.51■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 AK9Q5TCS8 1911 aa25.51■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 CRBNQ96SW2 442 aa25.5■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.5■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 OTOFQ9HC10 1997 aa25.5■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.5■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 TNNI2P48788 182 aa25.49■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 RASA3Q14644 834 aa25.49■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.49■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.48■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 CACNB3P54284 484 aa25.47■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 SLF2Q8IX21 1173 aa25.47■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 SNRKQ9NRH2 765 aa25.47■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 RGMBQ6NW40 437 aa25.47■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.47■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 BCL11AQ9H165 835 aa25.47■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.46■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 MOB2Q70IA6 237 aa25.46■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 GAKO14976 1311 aa25.45■■□□□ 1.67
NELFE-208ENST00000481121 MECOMQ03112 1051 aa25.45■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 PRKG1Q13976 671 aa25.45■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 RAI14Q9P0K7 980 aa25.45■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.45■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.44■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.44■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.44■■□□□ 1.66
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