RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-216ENST00000475195 MYO1BO43795 1136 aa20.29■□□□□ 0.84
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ATG4B-216ENST00000475195 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.29■□□□□ 0.84
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ATG4B-216ENST00000475195 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.28■□□□□ 0.84
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ATG4B-216ENST00000475195 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.27■□□□□ 0.84
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ATG4B-216ENST00000475195 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.24■□□□□ 0.83
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ATG4B-216ENST00000475195 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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ATG4B-216ENST00000475195 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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ATG4B-216ENST00000475195 MAP3K11Q16584 847 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-216ENST00000475195 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.19■□□□□ 0.82
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ATG4B-216ENST00000475195 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-216ENST00000475195 MOB2Q70IA6 237 aa20.17■□□□□ 0.82
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ATG4B-216ENST00000475195 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.16■□□□□ 0.82
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ATG4B-216ENST00000475195 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
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