RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 CERS5Q8N5B7 392 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEB6Q8N7X4 407 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MRIQ9BWK5 157 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 COL4A5P29400 1685 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GPC2Q8N158 579 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 OGFOD1Q8N543 542 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 APPBP2Q92624 585 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MXD3Q9BW11 206 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 F8W031 263 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 CERS3Q8IU89 383 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 DPF2Q92785 391 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GMLQ99445 158 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 RAD50Q92878 1312 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF541Q9H0D2 1346 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 SCN9AQ15858 1988 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 SBF1O95248 1867 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 BAG3O95817 575 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 USP17L8P0C7I0 530 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GRIK5Q16478 980 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 TEKT1Q969V4 418 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 AIDAQ96BJ3 306 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM227BQ96M60 508 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 SGSM2O43147 1006 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 PLCG2P16885 1265 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 CRKP46108 304 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 SCNN1DP51172 638 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF384Q8TF68 577 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 OSBP2Q969R2 916 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GAKO14976 1311 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0D9SFI3 127 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GLTPD2A6NH11 291 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 H7C1D1 291 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 REC8O95072 547 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 CHGBP05060 677 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GNAT2P19087 354 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP4CP60510 307 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf34Q49A92 452 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 AK9Q5TCS8 1911 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 PSME4Q14997 1843 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 DOCK2Q92608 1830 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-208ENST00000462602 GPAA1O43292 621 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 MBD4O95243 580 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 BTDP43251 543 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 DLGAP5Q15398 846 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP100Q494V2 611 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRA1Q86SQ6 560 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 MICALL2Q8IY33 904 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 MIGA1Q8NAN2 632 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R2C6 588 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO1BO43795 1136 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-208ENST00000462602 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms