RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 CRKP46108 304 aa11.69□□□□□ -0.54
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PKP4-208ENST00000462335 C2orf69Q8N8R5 385 aa11.69□□□□□ -0.54
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PKP4-208ENST00000462335 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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PKP4-208ENST00000462335 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
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PKP4-208ENST00000462335 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.63□□□□□ -0.55
PKP4-208ENST00000462335 GOLIM4O00461 696 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-208ENST00000462335 ZBTB22O15209 634 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-208ENST00000462335 IGSF3O75054 1194 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-208ENST00000462335 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
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PKP4-208ENST00000462335 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-208ENST00000462335 AK9Q5TCS8 1911 aa11.61□□□□□ -0.55
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