RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-208	ENST00000462335	CRK	P46108	304 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	PSME4	Q14997	1843 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	TRAF5	O00463	557 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	EGFR	P00533	1210 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF609	O15014	1411 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	GRM1	Q13255	1194 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	POTED	Q86YR6	584 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	BAG3	O95817	575 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	PRDX5	P30044	214 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	MCAM	P43121	646 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKP4-208	ENST00000462335	PASK	Q96RG2	1323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	ECE1	P42892	770 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	ZAP70	P43403	619 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	HTRA3	P83110	453 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	ERC2	O15083	957 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	PLCG2	P16885	1265 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	HUNK	P57058	714 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	MECOM	Q03112	1051 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	PRKG1	Q13976	671 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	RASA3	Q14644	834 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	GRIK5	Q16478	980 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	GOLIM4	O00461	696 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	ZBTB22	O15209	634 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	IGSF3	O75054	1194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PKP4-208	ENST00000462335	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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