RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.3■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 MRIQ9BWK5 157 aa22.3■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.3■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 WNT10BO00744 389 aa22.29■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 ATP5JP18859 108 aa22.29■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 CRKP46108 304 aa22.29■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.29■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 TEKT1Q969V4 418 aa22.29■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.29■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.29■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.28■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.28■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.27■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 SPDYE6P0CI01 402 aa22.27■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 CNTROBQ8N137 903 aa22.27■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 RAI14Q9P0K7 980 aa22.27■■□□□ 1.16
PTX4-202ENST00000440447 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 MYO1BO43795 1136 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 NUCB1Q02818 461 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 SLF2Q8IX21 1173 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 LNPKQ9C0E8 428 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 GGA3Q9NZ52 723 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.26■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 C1QTNF8P60827 252 aa22.25■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 IGSF3O75054 1194 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 MECOMQ03112 1051 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 HAUS7Q99871 368 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.24■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 ERC2O15083 957 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 MX1P20591 662 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 GSTO1P78417 241 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.23■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 GOLIM4O00461 696 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 LDHCP07864 332 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 USP48Q86UV5 1035 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 SULF1Q8IWU6 871 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.22■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 CLRN2A0PK11 232 aa22.21■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.21■■□□□ 1.15
PTX4-202ENST00000440447 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 MAP3K12Q12852 859 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 VEZTQ9HBM0 779 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 STAP2Q9UGK3 403 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.2■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 ZNF384Q8TF68 577 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 GAKO14976 1311 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 AOX1Q06278 1338 aa22.19■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 ADM5C9JUS6 153 aa22.18■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 PDE1AP54750 535 aa22.18■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.18■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.18■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 PASKQ96RG2 1323 aa22.17■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 TRAF5O00463 557 aa22.17■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.16■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 CYP7A1P22680 504 aa22.16■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 BTDP43251 543 aa22.16■■□□□ 1.14
PTX4-202ENST00000440447 TNFAIP1Q13829 316 aa22.16■■□□□ 1.14
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