RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.12■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 GORABQ5T7V8 394 aa27.12■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRDX5P30044 214 aa27.11■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAST3O60307 1309 aa27.11■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLRN2A0PK11 232 aa27.1■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYO1BO43795 1136 aa27.1■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.1■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 JMYQ8N9B5 988 aa27.1■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.1■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 TEKT1Q969V4 418 aa27.1■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.1■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 ECM29Q5VYK3 1845 aa27.09■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.09■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPDYE2Q495Y8 402 aa27.09■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.09■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZDHHC15Q96MV8 337 aa27.09■■□□□ 1.93
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IGHV3-20-201ENST00000390606 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 MCAMP43121 646 aa27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 HHIPL2Q6UWX4 724 aa27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 PI16Q6UXB8 463 aa27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 CRBNQ96SW2 442 aa27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-20-201ENST00000390606 LDHBP07195 334 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
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IGHV3-20-201ENST00000390606 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPATA5Q8NB90 893 aa27.07■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.07■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.07■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAB11FIP3O75154 756 aa27.06■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 VEGFBP49765 207 aa27.06■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.06■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.06■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 VEZTQ9HBM0 779 aa27.06■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.05■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.05■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 AACSQ86V21 672 aa27.05■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.05■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 APBB1O00213 710 aa27.04■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.04■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.04■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 ABCF2Q9UG63 623 aa27.04■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa27.04■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa27.03■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 HUNKP57058 714 aa27.02■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.02■■□□□ 1.92
IGHV3-20-201ENST00000390606 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.01■■□□□ 1.91
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IGHV3-20-201ENST00000390606 RASA3Q14644 834 aa27.01■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP4F22Q6NT55 531 aa27.01■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 SNRKQ9NRH2 765 aa27.01■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 GAKO14976 1311 aa27■■□□□ 1.91
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IGHV3-20-201ENST00000390606 ERICH6Q7L0X2 663 aa27■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF384Q8TF68 577 aa27■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 CAPNS2Q96L46 248 aa27■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 DCTPP1Q9H773 170 aa27■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.99■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 CACNB3P54284 484 aa26.99■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNFAIP1Q13829 316 aa26.99■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 MOB2Q70IA6 237 aa26.99■■□□□ 1.91
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IGHV3-20-201ENST00000390606 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.98■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.98■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 NF2P35240 595 aa26.98■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 ECE1P42892 770 aa26.98■■□□□ 1.91
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IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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IGHV3-20-201ENST00000390606 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.97■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.97■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 TEPSINQ96N21 525 aa26.97■■□□□ 1.91
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IGHV3-20-201ENST00000390606 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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IGHV3-20-201ENST00000390606 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.95■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNNI2P48788 182 aa26.95■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.95■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.95■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.95■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.94■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.94■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM83AQ86UY5 434 aa26.94■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLF2Q8IX21 1173 aa26.94■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.94■■□□□ 1.9
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAI14Q9P0K7 980 aa26.94■■□□□ 1.9
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