RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 TRPM7Q96QT4 1865 aa33.23■■■□□ 2.91
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TPGS1-201ENST00000359315 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
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TPGS1-201ENST00000359315 HMG20BQ9P0W2 317 aa33.23■■■□□ 2.91
TPGS1-201ENST00000359315 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
TPGS1-201ENST00000359315 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa33.23■■■□□ 2.91
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TPGS1-201ENST00000359315 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
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TPGS1-201ENST00000359315 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
TPGS1-201ENST00000359315 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa33.22■■■□□ 2.91
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TPGS1-201ENST00000359315 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
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TPGS1-201ENST00000359315 MYO1BO43795 1136 aa33.19■■■□□ 2.9
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TPGS1-201ENST00000359315 MAST3O60307 1309 aa33.19■■■□□ 2.9
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TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa33.17■■■□□ 2.9
TPGS1-201ENST00000359315 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
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TPGS1-201ENST00000359315 AACSQ86V21 672 aa33.17■■■□□ 2.9
TPGS1-201ENST00000359315 ABCF2Q9UG63 623 aa33.17■■■□□ 2.9
TPGS1-201ENST00000359315 CACNB3P54284 484 aa33.16■■■□□ 2.9
TPGS1-201ENST00000359315 HUNKP57058 714 aa33.16■■■□□ 2.9
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TPGS1-201ENST00000359315 TTC39AQ5SRH9 613 aa33.16■■■□□ 2.9
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TPGS1-201ENST00000359315 FZD1Q9UP38 647 aa33.13■■■□□ 2.89
TPGS1-201ENST00000359315 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
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TPGS1-201ENST00000359315 RAB11FIP3O75154 756 aa33.1■■■□□ 2.89
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TPGS1-201ENST00000359315 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
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TPGS1-201ENST00000359315 MECOMQ03112 1051 aa33.09■■■□□ 2.89
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TPGS1-201ENST00000359315 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa33.09■■■□□ 2.89
TPGS1-201ENST00000359315 GAKO14976 1311 aa33.08■■■□□ 2.89
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2Q2LH0YL09 131 aa33.08■■■□□ 2.89
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TPGS1-201ENST00000359315 TNFAIP1Q13829 316 aa33.06■■■□□ 2.88
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TPGS1-201ENST00000359315 RGMBQ6NW40 437 aa33.05■■■□□ 2.88
TPGS1-201ENST00000359315 ZIC5Q96T25 663 aa33.05■■■□□ 2.88
TPGS1-201ENST00000359315 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
TPGS1-201ENST00000359315 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
TPGS1-201ENST00000359315 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
TPGS1-201ENST00000359315 DCTPP1Q9H773 170 aa33.04■■■□□ 2.88
TPGS1-201ENST00000359315 RAI14Q9P0K7 980 aa33.04■■■□□ 2.88
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