RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 RXRBP28702 533 aa25.39■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.39■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 GNAT2P19087 354 aa25.38■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 APOBRQ0VD83 1088 aa25.38■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 MRE11P49959 708 aa25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 CRY2Q49AN0 593 aa25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF3Q9H094 633 aa25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF445P59923 1031 aa25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 MBD4O95243 580 aa25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 USP48Q86UV5 1035 aa25.36■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 PRC1O43663 620 aa25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 APBA3O96018 575 aa25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 APPP05067 770 aa25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 DTNBO60941 627 aa25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 AKT1S1Q96B36 256 aa25.35■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 JAK2O60674 1132 aa25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 ANTXR2P58335 489 aa25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 TRDNQ13061 729 aa25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 CHST3Q7LGC8 479 aa25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.34■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 DDR1Q08345 913 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 EP400Q96L91 3159 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 ARMT1Q9H993 441 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SNRNP25-201ENST00000293861 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 KLRK1P26718 216 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF827Q17R98 1081 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXO41Q8TF61 875 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 NAPBQ9H115 298 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCF2Q9UG63 623 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 XDHP47989 1333 aa25.32■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 CTDNEP1O95476 244 aa25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 RAI14Q9P0K7 980 aa25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF3AQ9Y496 699 aa25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP7A1P22680 504 aa25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 LCORLQ8N3X6 602 aa25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.31■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.3■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 IGSF3O75054 1194 aa25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 UBE2HP62256 183 aa25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.29■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM87BQ96K49 555 aa25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.28■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 BBOX1O75936 387 aa25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.27■■□□□ 1.64
SNRNP25-201ENST00000293861 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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