RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 SBF1O95248 1867 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L3A6NCW0 530 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L4A6NCW7 530 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 PSMD14O00487 310 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 CYP7A1P22680 504 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 SCNN1DP51172 638 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 DACT2Q5SW24 774 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 SGSM2O43147 1006 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 MAST3O60307 1309 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 CXCL9Q07325 125 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 JDP2Q8WYK2 163 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 PTH1RQ03431 593 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 VPS53Q5VIR6 699 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 CASC1Q6TDU7 716 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.36■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.36■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 SHTN1A0MZ66 631 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 GSE1Q14687 1217 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 APPBP2Q92624 585 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ARMT1Q9H993 441 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 VPS33BQ9H267 617 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 HIP1O00291 1037 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 LMNB1P20700 586 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 UBE3CQ15386 1083 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 LCORLQ8N3X6 602 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 RNF181Q9P0P0 153 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 PRKAB2O43741 272 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 MBD4O95243 580 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB22O15209 634 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 GPAA1O43292 621 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 PSME4Q14997 1843 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 FZD9O00144 591 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 FOXP2O15409 715 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 USP26Q9BXU7 913 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 AIDAQ96BJ3 306 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 GMLQ99445 158 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 BTDP43251 543 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 CRKP46108 304 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 SMIM22K7EJ46 135 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 EGFRP00533 1210 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 PALD1Q9ULE6 856 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 RAD50Q92878 1312 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 REC8O95072 547 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 APPP05067 770 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms