RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 SBF1O95248 1867 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L3A6NCW0 530 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L4A6NCW7 530 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 PSMD14O00487 310 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 CYP7A1P22680 504 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 SCNN1DP51172 638 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 DACT2Q5SW24 774 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRT1-201ENST00000211413 SGSM2O43147 1006 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 MAST3O60307 1309 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 CXCL9Q07325 125 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 JDP2Q8WYK2 163 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 PTH1RQ03431 593 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 VPS53Q5VIR6 699 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 CASC1Q6TDU7 716 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.36■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.36■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 SHTN1A0MZ66 631 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 GSE1Q14687 1217 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 APPBP2Q92624 585 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ARMT1Q9H993 441 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 VPS33BQ9H267 617 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 HIP1O00291 1037 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 LMNB1P20700 586 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 UBE3CQ15386 1083 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 LCORLQ8N3X6 602 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 RNF181Q9P0P0 153 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 PRKAB2O43741 272 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 MBD4O95243 580 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.33■■□□□ 1.17
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB22O15209 634 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 GPAA1O43292 621 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 PSME4Q14997 1843 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 FZD9O00144 591 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 FOXP2O15409 715 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 USP26Q9BXU7 913 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 AIDAQ96BJ3 306 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 GMLQ99445 158 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 BTDP43251 543 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 CRKP46108 304 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.27■■□□□ 1.16
PRRT1-201ENST00000211413 SMIM22K7EJ46 135 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 EGFRP00533 1210 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 PALD1Q9ULE6 856 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 RAD50Q92878 1312 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 REC8O95072 547 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 APPP05067 770 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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