RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635841.1

XIST-211, X inactive specific transcript, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene XIST, Length 1,734 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIST-211ENST00000635841 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.17□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.17□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 H7C2Y5 167 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 TXNL1O43396 289 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 OR2A4O95047 310 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 S1PR2O95136 353 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 HPRT1P00492 218 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 IGKV1-39P01597 117 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 IGKV1D-39P04432 117 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 RRASP10301 218 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 EPHA1P21709 976 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 RAP2BP61225 183 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 MOB3BQ86TA1 216 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 ASB13Q8WXK3 278 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 SEC22AQ96IW7 307 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 OR2A7Q96R45 310 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 NABP2Q9BQ15 211 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.16□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 H0YJW9 148 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 J3QLI3 93 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 CRYZL1O95825 349 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 KRASP01116 189 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 VDAC1P21796 283 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 AKR1C2P52895 323 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 R3HDM4Q96D70 268 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 OR10C1Q96KK4 312 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 C2orf50Q96LR7 162 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 ACANP16112 2415 aa7.15□□□□□ -1.26
XIST-211ENST00000635841 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 MPTX1A8MV57 137 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 OOSP1A8MZH6 123 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 NPFFO15130 113 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 IGKV1-5P01602 117 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 IGHV1-69P01742 117 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 IGKV1-16P04430 117 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 NQO2P16083 231 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 MC5RP33032 325 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 G6PCP35575 357 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 RAB13P51153 203 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 ERVK-16P61578 105 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 SSX2Q16385 188 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 MIDNQ504T8 468 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 NMSQ5H8A3 153 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 GPR157Q5UAW9 335 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 PDPNQ86YL7 162 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 SPIN2AQ99865 258 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 NMES1Q9C002 83 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 COMMD9Q9P000 198 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.15□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 AKAP9Q99996 3911 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 A0A1W2PPI3 338 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 MARCH11A6NNE9 402 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 SMLR1H3BR10 107 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 HRASP01112 189 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 SAA4P35542 130 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 SSX9Q7RTT3 188 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 FAM219AQ8IW50 185 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 OR8H3Q8N146 312 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 C17orf50Q8WW18 174 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 GPR146Q96CH1 333 aa7.14□□□□□ -1.27
XIST-211ENST00000635841 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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