RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	KMT2A	Q03164	3969 aa		9.01	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	MSGN1	A6NI15	193 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF785	A8K8V0	405 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TRDC	B7Z8K6	153 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	BET1	O15155	118 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	SHOX	O15266	292 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	FABP7	O15540	132 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK1	P06493	297 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	OR9G9	P0C7N8	305 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOG	P84095	191 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TNXA	Q16473	311 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS8	Q16651	343 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	DDB2	Q92466	427 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	SNAPC3	Q92966	411 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM203	Q969S6	136 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	PHB2	Q99623	299 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	MND1	Q9BWT6	205 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		9	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0B4J203	849 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00473	A8K010	186 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TPPP	O94811	219 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	FCGR3A	P08637	254 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTT2	P0CG29	244 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTT2B	P0CG30	244 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	SPHAR	Q15513	63 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB11B	Q15907	218 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TATDN3	Q17R31	274 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	RNLS	Q5VYX0	342 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	LAX1	Q8IWV1	398 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	PEMT	Q9UBM1	199 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		8.99	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM223B	A6NKX1	122 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP5D1	E7EU14	171 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYZL1	O95825	349 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINB10	P48595	397 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2K	P61086	200 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	MED22	Q15528	200 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	RTL8B	Q17RB0	113 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	IL17D	Q8TAD2	202 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	C8orf4	Q9NR00	106 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		8.98	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf70	A6NJV1	201 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	OR11H12	B2RN74	326 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	MPPED1	O15442	326 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	AIRE	O43918	545 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	IRF3	Q14653	427 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	RCN1	Q15293	331 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	GUCA2B	Q16661	112 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX45	Q8NA69	505 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		8.97	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		8.96	□□□□□ -0.97
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGES3L	E9PB15	166 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	MFNG	O00587	321 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2J3	O76001	311 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	FOLR2	P14207	255 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP5G2	Q06055	141 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	CBX3	Q13185	183 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	C15orf32	Q32M92	178 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	HES5	Q5TA89	166 aa		8.96	□□□□□ -0.98
TTLL3-233	ENST00000602338	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	8.96	□□□□□ -0.98

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