RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 CRYGBP07316 175 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ELANEP08246 267 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 NAT1P18440 290 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 FXYD4P59646 89 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ECSCRQ19T08 205 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 KCTD9Q7L273 389 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF152Q8N8N0 203 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 EHFQ9NZC4 300 aa14.55□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 G3V4G9 280 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 TNFSF12O43508 249 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PF4P02776 101 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PSMB8P28062 276 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 HLA-DMAP28067 261 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 KLK15Q9H2R5 256 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.54□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PLXNB1O43157 2135 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 CTDSP2O14595 271 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 IGLV1-40P01703 118 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 GNB1P62873 340 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 DEFA6Q01524 100 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 DYRK1AQ13627 763 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 FXYD3Q14802 87 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF695Q8IW36 515 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MFSD4AQ8N468 514 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 DUX3Q96PT4 197 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.53□□□□□ -0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 H3BMQ9 156 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 SOX15O60248 233 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 HRH1P35367 487 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 TAS2R46P59540 309 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM65Q6PI78 240 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM17Q86X19 198 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ARPC1AQ92747 370 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ISOC1Q96CN7 298 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 SCOCQ9UIL1 159 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.52□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PN81 502 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 RGS5O15539 181 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 CNIH1O95406 144 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 CD33P20138 364 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 CHRNA7P36544 502 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE2KP61086 200 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 HERV-K104P61576 105 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 MSMO1Q15800 293 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 DEFB136Q30KP8 78 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 LAX1Q8IWV1 398 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 LFNGQ8NES3 379 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ABHD1Q96SE0 405 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.51□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 SULT1C2O00338 296 aa14.5□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 RCVRNP35243 200 aa14.5□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 RAB9AP51151 201 aa14.5□□□□□ -0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.7 ms