RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, human

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDSPL-208	ENST00000486978	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		5	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		5	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978		A0A087WXM4	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	FCN1	O00602	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM127	O75204	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	LINC00205	P59089	165 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	GNG2	P59768	71 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	CBX3	Q13185	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	PSG5	Q15238	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	DPF1	Q92782	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978		A0A0A6YYH2	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978		A0A1W2PN81	502 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978		A6NJ64	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978		I3L521	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	SLC25A17	O43808	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	SSX5	O60225	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	SOX15	O60248	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	CA2	P00918	260 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	RRAS	P10301	218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	CHRNA7	P36544	502 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	LGALS7	P47929	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	RAB9A	P51151	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	RAB25	P57735	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	RUNX1	Q01196	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	FHL3	Q13643	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	LINC00473	A8K010	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	SHOX	O15266	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	AIRE	O43918	545 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	SLC22A5	O76082	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	CRYGB	P07316	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	CD40LG	P29965	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	GNB1	P62873	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	FXYD3	Q14802	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CTDSPL-208	ENST00000486978	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms