RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464		U3KQK5	164 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		9.18	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	LY86	O95711	162 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	PSMB9	P28065	219 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	UBE2K	P61086	200 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFA5	Q01523	94 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ARFRP1	Q13795	201 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	HACD4	Q5VWC8	232 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5T1	Q8NG75	326 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	STUB1	Q9UNE7	303 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		9.17	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM235	A6NFC5	223 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	CRYZL1	O95825	349 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	HLA-DQB1	P01920	261 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	RRAS	P10301	218 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	DYRK1A	Q13627	763 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	PRSS8	Q16651	343 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TPRA1	Q86W33	373 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TEX45	Q8NA69	505 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	FCGR1B	Q92637	280 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	GINS4	Q9BRT9	223 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	OR51E2	Q9H255	320 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		9.16	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SHOX	O15266	292 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TUSC2	O75896	110 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	CNIH1	O95406	144 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV1-51	P01701	117 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TRBV12-3	P01733	135 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	GP9	P14770	177 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TALDO1	P37837	337 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	PITPNA	Q00169	270 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ARL6IP1	Q15041	203 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	RTL8B	Q17RB0	113 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF773	Q6PK81	442 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM68	Q96MH6	324 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		9.15	□□□□□ -0.94
PTPRF-211	ENST00000467464	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	MSGN1	A6NI15	193 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464		J3QRK9	145 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	APELA	P0DMC3	54 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	CD40LG	P29965	261 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SDC2	P34741	201 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF45	Q02386	682 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	CBX3	Q13185	183 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TNXA	Q16473	311 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	CNIH2	Q6PI25	160 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464		Q8N1Y9	231 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	CENPO	Q9BU64	300 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	RYR2	Q92736	4967 aa		9.14	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A0G2JLM5	398 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GW64	132 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		9.13	□□□□□ -0.95
PTPRF-211	ENST00000467464	OR9G9	P0C7N8	305 aa		9.13	□□□□□ -0.95

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