RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM56Q96MV1 263 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TP53RKQ96S44 253 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB18Q9NP72 206 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 CUBNO60494 3623 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 PRAF2O60831 178 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 RAMP3O60896 148 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SFT2D2O95562 160 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 IGKV1-39P01597 117 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 IGKV1-16P04430 117 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 IGKV1D-39P04432 117 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 CRYBA1P05813 215 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4E1P0C645 316 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 P0C879 139 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 RRASP10301 218 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 PAX6P26367 422 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 MC5RP33032 325 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB13P51153 203 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM187Q14656 261 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 OR51H1Q8NH63 302 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SSX3Q99909 188 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 COMMD9Q9P000 198 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A0B4J2A0 478 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 C9orf170A2RU37 121 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 DBX1A6NMT0 343 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 H3BUX3 64 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 CLDN34H7C241 214 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 CDS2O95674 445 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLV2-23P01705 113 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 APOA2P02652 100 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 OR5AC1P0C628 307 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 RPA2P15927 270 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 S100GP29377 79 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 IER3P46695 156 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 RTL8BQ17RB0 113 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 LYG2Q86SG7 212 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4S2Q8NH73 311 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 MITD1Q8WV92 249 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 IL22RA2Q969J5 263 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF5Q99942 180 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TCF19Q9Y242 345 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 NF1P21359 2839 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 A6NDX4 124 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFA3O95167 84 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SPDEFO95238 335 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 HPRT1P00492 218 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 MOSP00540 346 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV4-59P01825 116 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 CRYGBP07316 175 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 FGF2P09038 288 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM106CPP0CH98 169 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 AKR1C4P17516 323 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SRPXP78539 464 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 HES1Q14469 280 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TATDN3Q17R31 274 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM16LQ309B1 348 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 AARDQ4LEZ3 155 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZNX1 250 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms