RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 GNG7O60262 68 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SPINK4O60575 86 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 HERPUD1Q15011 391 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 RSG1Q9BU20 258 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TM2D1Q9BX74 207 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PRR19A6NJB7 356 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 H0Y980 276 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CTSSP25774 331 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 MMDQ15546 238 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SYNGR1O43759 233 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 IGLV3-19P01714 112 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 G6PCP35575 357 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 IGSF23A1L1A6 192 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 IGHV2-5P01817 119 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FCER1GP30273 86 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 BMI1P35226 326 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 COL10A1Q03692 680 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SSX8Q7RTT4 187 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 LRP11Q86VZ4 500 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.57□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PLXNA3P51805 1871 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ZNF253O75346 499 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SMIM17P0DL12 118 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 MPV17P39210 176 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FGF12P61328 243 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PET117Q6UWS5 81 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 DIRC3C9JPN6 131 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ZNF883P0CG24 379 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 LCN2P80188 198 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ICAM4Q14773 271 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ZNF738Q8NE65 137 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ZNF596Q8TC21 504 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 WBP1Q96G27 269 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ATG101Q9BSB4 218 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PSG2P11465 335 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ACP1P24666 158 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR4X1Q8NH49 305 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 RPRMQ9NS64 109 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 PRNDQ9UKY0 176 aa8.56□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 NPY1RP25929 384 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TNFRSF9Q07011 255 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TP53RKQ96S44 253 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 VENTXO95231 258 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FREM3P0C091 2139 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 J3QR06 171 aa8.55□□□□□ -1.04
TNS1-209ENST00000446688 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms