RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP57Q9NU63 452 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL36GQ9NZH8 169 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 SORL1Q92673 2214 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PPQ1 181 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINE3A8MV23 424 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 LY6LH3BQJ8 138 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 C15orf65H3BRN8 121 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCD6O75340 191 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK1P06493 297 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNTFRP26992 372 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ3P48549 501 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB7AP51149 207 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLDN12P56749 244 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 UNC119Q13432 240 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf183Q5T699 404 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00596Q86U02 117 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRAPQ8TCY5 172 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CORO2AQ92828 525 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 UFD1Q92890 307 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGK494Q96LW2 274 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNBD2Q96M20 576 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4F4Q96R69 305 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHOFQ9HBH0 211 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8orf4Q9NR00 106 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF150Q9ULK6 438 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A075B6Q4 140 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0A6YYD4 124 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0B4J203 849 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 H0YHG0 523 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT-ND4P03905 459 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM18P0DKX4 95 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CGB3P0DN86 165 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CGB7P0DN87 165 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL3RAP26951 378 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR3A3P47888 321 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10A3P58181 314 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35A2P78381 396 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFA5Q01523 94 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR176Q14439 515 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPHARQ15513 63 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMDQ15546 238 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECSCRQ19T08 205 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 HES5Q5TA89 166 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASCL4Q6XD76 172 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8H3Q8N146 312 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5B12Q96R08 314 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 CST11Q9H112 138 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.2 ms