RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF695Q8IW36 515 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 HARBI1Q96MB7 349 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 P2RX4Q99571 388 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 GON7Q9BXV9 100 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 GNB4Q9HAV0 340 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PN81 502 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 NUDT19A8MXV4 375 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 SHOXO15266 292 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 TNFSF12O43508 249 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 FCGR3BO75015 233 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CRYZL1O95825 349 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 PPYP01298 95 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 APOA1P02647 267 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 PMP2P02689 132 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 NAT1P18440 290 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CD33P20138 364 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CHRNA7P36544 502 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 RFX2P48378 723 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 LFNGQ8NES3 379 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 GPX8Q8TED1 209 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CMTM3Q96MX0 182 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS3P35030 304 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CBX5P45973 191 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 LGALS7P47929 136 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 RAB9AP51151 201 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 FXYD4P59646 89 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 GNB1P62873 340 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 FXYD3Q14802 87 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CDK10Q15131 360 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 RTL8BQ17RB0 113 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 KCTD9Q7L273 389 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 MFSD4AQ8N468 514 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.35□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 OR5B12Q96R08 314 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 IFT46Q9NQC8 304 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 TNCP24821 2201 aa8.35□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CCL24O00175 119 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CTDSP2O14595 271 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 RAMP3O60896 148 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 RRASP10301 218 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DMAP28067 261 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 MYCNOSP40205 109 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP10-11P60412 298 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2KP61086 200 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 DYRK1AQ13627 763 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 MS4A10Q96PG2 267 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 EHFQ9NZC4 300 aa8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 FAM25AB3EWG3 89 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 FAM25CB3EWG5 89 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 FAM25GB3EWG6 89 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 I3L521 148 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 SLC22A5O76082 557 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 APELAP0DMC3 54 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 GNRHRP30968 328 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 HRH1P35367 487 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 DEFA5Q01523 94 aa8.33□□□□□ -1.08
ATG4B-210ENST00000428861 FHL3Q13643 280 aa8.33□□□□□ -1.08
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