RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 IGLV2-14P01704 120 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 IGLV2-23P01705 113 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 APOA1P02647 267 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 PF4P02776 101 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 CRYGBP07316 175 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 MYCNOSP40205 109 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 LINC00205P59089 165 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 CX3CL1P78423 397 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RUNX1Q01196 453 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 CTF1Q16619 201 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RTL8BQ17RB0 113 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 BEST4Q8NFU0 473 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 SNAPC3Q92966 411 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 PARP11Q9NR21 331 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RYR2Q92736 4967 aa6.89□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 LINC00473A8K010 186 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 G3V318 75 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 FCN1O00602 326 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 BRI3O95415 125 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 NAT1P18440 290 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 ALDH3B2P48448 385 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 ARPC4P59998 168 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 VBP1P61758 197 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 CBX3Q13185 183 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 FHL3Q13643 280 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 PLGLAQ15195 96 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RAX2Q96IS3 184 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 HARBI1Q96MB7 349 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 NUDT19A8MXV4 375 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 SLC25A17O43808 307 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 SOX15O60248 233 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 TPPPO94811 219 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 CA2P00918 260 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 TAS2R20P59543 309 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 UBE2KP61086 200 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 KCTD9Q7L273 389 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 TEX45Q8NA69 505 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 BVESQ8NE79 360 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 ARPC1AQ92747 370 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 KLK15Q9H2R5 256 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.87□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 H3BUA1 57 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 I3L521 148 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 CCL24O00175 119 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 SHOXO15266 292 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 CRYZL1O95825 349 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 PPYP01298 95 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 PTHLHP12272 177 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 IGLL1P15814 213 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 AADACP22760 399 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 FCGR2CP31995 323 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00963-204ENST00000427778 RAB9AP51151 201 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms