RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559948.5

PSMA4-216, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-216ENST00000559948 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PSMA4-216ENST00000559948 TMED9Q9BVK6 235 aa6.72□□□□□ -1.33
PSMA4-216ENST00000559948 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PSMA4-216ENST00000559948 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.72□□□□□ -1.33
PSMA4-216ENST00000559948 LCE6AA0A183 80 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 A6NJY4 79 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 EBAG9O00559 213 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 LDLRAD4O15165 306 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 HSPA12AO43301 675 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TRGV3P03979 118 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TPPP2P59282 170 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 HLA-DRB3P79483 266 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 PITPNAQ00169 270 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 PLGLAQ15195 96 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SPHARQ15513 63 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 OR5T1Q8NG75 326 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ZMAT4Q9H898 229 aa6.71□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 PTGES3LE9PB15 166 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 H3BUA1 57 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SLC17A2O00624 439 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SLC25A17O43808 307 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SPDEFO95238 335 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 CD3GP09693 182 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ARSBP15848 533 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 CPEP16870 476 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 CD40LGP29965 261 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 VEGFCP49767 419 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 PLA2G7Q13093 441 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TPBGQ13641 420 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 P2RY14Q15391 338 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 PDPNQ86YL7 162 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 POC5Q8NA72 575 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SETD6Q8TBK2 473 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TMEM203Q969S6 136 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 C5orf30Q96GV9 206 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 MND1Q9BWT6 205 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 PECRQ9BY49 303 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 RDH8Q9NYR8 311 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 STUB1Q9UNE7 303 aa6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 A0A0G2JLM5 398 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TRDCB7Z8K6 153 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TRBV12-3P01733 135 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 CSN3P07498 182 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ZP3P21754 424 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 LGALS7P47929 136 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 CLDN12P56749 244 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 DYRK1AQ13627 763 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 RCN1Q15293 331 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 HAGHQ16775 308 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TMEM177Q53S58 311 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 IGSF11Q5DX21 431 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TMEM68Q96MH6 324 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 DUSP21Q9H596 190 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ZNF221Q9UK13 617 aa6.69□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 MSGN1A6NI15 193 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 M0R1X1 148 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 GSTT2P0CG29 244 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 GSTT2BP0CG30 244 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 SYNJ2BPP57105 145 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 MED22Q15528 200 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 DDB2Q92466 427 aa6.68□□□□□ -1.34
PSMA4-216ENST00000559948 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms