RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 CCDC140Q96MF4 163 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 CSTL1Q9H114 145 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 GPX5O75715 221 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 OR2J3O76001 311 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 IGHV3-23P01764 117 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 AMBPP02760 352 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 NECAP1Q8NC96 275 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 OR5B3Q8NH48 314 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 DNAJC9Q8WXX5 260 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 NSL1Q96IY1 281 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 C4orf36Q96KX1 117 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 JAM3Q9BX67 310 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ZNF320A2RRD8 509 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 MPTX1A8MV57 137 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 E9PI62 339 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 J3QLW9 94 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ITGB1BP1O14713 200 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 TSPAN4O14817 238 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 BAG2O95816 211 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 CD74P04233 296 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 SCTP09683 121 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 T-ENOLP0DO92 83 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ZNF19P17023 458 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ATP6V1E1P36543 226 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ZNF585BQ52M93 769 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 FAM209BQ5JX69 171 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 OR4A5Q8NH83 315 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 PHB2Q99623 299 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 GLAP06280 429 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ADMP35318 185 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ARL3P36405 182 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 SOX2P48431 317 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 TMED1Q13445 227 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 MED21Q13503 144 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 DDI2Q5TDH0 399 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 SETD9Q8NE22 299 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 MARC2Q969Z3 335 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 ORAI1Q96D31 301 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 LRRC42Q9Y546 428 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 S4R3C0 116 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-208ENST00000547298 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 DAPL1A0PJW8 107 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 TMEM212A6NML5 194 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 EPM2AB3EWF7 344 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 FUT3P21217 361 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 CAPGP40121 348 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 MAP2K4P45985 399 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 MNAT1P51948 309 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 PRSS8Q16651 343 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 OR4A47Q6IF82 309 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 S100A13Q99584 98 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 BANF2Q9H503 90 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 SHOXO15266 292 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 FAM107AO95990 144 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 BDKRB2P30411 391 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 MED22Q15528 200 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-208ENST00000547298 TNXAQ16473 311 aa8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 189 ms