RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 CHPT1Q8WUD6 406 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 NUDT15Q9NV35 164 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 VSIG4Q9Y279 399 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.47□□□□□ -0.89
NISCH-211ENST00000488243 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 M0R1X1 148 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 PEX14O75381 377 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 APOA2P02652 100 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 RLN1P04808 185 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 IL5P05113 134 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 ANXA3P12429 323 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 RPA2P15927 270 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 F2RP25116 425 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 CD1BP29016 333 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 RAB13P51153 203 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 DHODHQ02127 395 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 OXA1LQ15070 435 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 UTF1Q5T230 341 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 GALNT14Q96FL9 552 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 RNF5Q99942 180 aa9.46□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 VGLL3A8MV65 326 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 PROP1O75360 226 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 ATG12O94817 140 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 DLX1P56177 255 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 SRPXP78539 464 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 BAMBIQ13145 260 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 RTL8BQ17RB0 113 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 PDPNQ86YL7 162 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 NABP2Q9BQ15 211 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 H0Y980 276 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 CT45A6P0DMU7 189 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 CT45A5P0DMU8 189 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 CT45A7P0DMV0 189 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 AKR1C4P17516 323 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 SSX2Q16385 188 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 RPL39P5Q59GN2 51 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 CADM3Q8N126 398 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 OR4S2Q8NH73 311 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 DDB2Q92466 427 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 IL22RA2Q969J5 263 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 NAA60Q9H7X0 242 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.44□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 A0A0B4J2A0 478 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PPI3 338 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PRD5 423 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PRF3 423 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PRM7 423 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 OR4E1P0C645 316 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 FAM106CPP0CH98 169 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 LGALS7P47929 136 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 EBI3Q14213 229 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 MOB3BQ86TA1 216 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.43□□□□□ -0.9
NISCH-211ENST00000488243 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.7 ms