RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 TGFBR1P36897 503 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 FABP5Q01469 135 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 MXD1Q05195 221 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 MMDQ15546 238 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 Q3ZCU0 254 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 ACSM6Q6P461 480 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF429Q86V71 674 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 TPRA1Q86W33 373 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 GAPTQ8N292 157 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 ARPC1AQ92747 370 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 NABP2Q9BQ15 211 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 TOLLIPQ9H0E2 274 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 METTL9Q9H1A3 318 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 RNF167Q9H6Y7 350 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 PARP11Q9NR21 331 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
HOXD8-202ENST00000429017 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 LINC01619G3V211 115 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEB3O15480 346 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 OGG1O15527 345 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-DRB1P01911 266 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 OR5H8P0DN80 308 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 IL3RAP26951 378 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SDC2P34741 201 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ACTBP60709 375 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 OXA1LQ15070 435 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 MPV17LQ2QL34 196 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 MORN2Q502X0 79 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 DDI2Q5TDH0 399 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SIGIRRQ6IA17 410 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM65Q6PI78 240 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CENPSQ8N2Z9 138 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 PRR18Q8N4B5 295 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 PHYHIPQ92561 330 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 THRSPQ92748 146 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ETAA1Q9NY74 926 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 GNG12Q9UBI6 72 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PN81 502 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 FCN1O00602 326 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 NBR2O15453 112 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TXNL1O43396 289 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFA3O95167 84 aa5.01□□□□□ -1.61
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HOXD8-202ENST00000429017 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 BDKRB2P30411 391 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CHRNA7P36544 502 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 OR3A3P47888 321 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 DEFA1P59665 94 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 DEFA3P59666 94 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 PPP3R1P63098 170 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 IFITM3Q01628 133 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ECSCRQ19T08 205 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00596Q86U02 117 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC190Q86UF4 302 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 NPBQ8NG41 125 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 GPR148Q8TDV2 347 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 NEK7Q8TDX7 302 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 GHSRQ92847 366 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM106AQ96A25 262 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM19Q96E16 107 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 ZMAT4Q9H898 229 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 GAB2Q9UQC2 676 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2QL1A1L167 161 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 PDCD5O14737 125 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 LDLRAD4O15165 306 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SPINT2O43291 252 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 UPK1BO75841 260 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 SC5DO75845 299 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3-11P01762 117 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
HOXD8-202ENST00000429017 GTF2F2P13984 249 aa5.01□□□□□ -1.61
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