RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PPK0 400 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 IGLV2-23P01705 113 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 MGMTP16455 207 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 CD40LGP29965 261 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 RPEL1Q2QD12 228 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 SPACA1Q9HBV2 294 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 GMPPBQ9Y5P6 360 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 H3BUA1 57 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 GYG2O15488 501 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 OR2A4O95047 310 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 PRH1P02810 166 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 CRYGBP07316 175 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 FUT3P21217 361 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 PPP3R1P63098 170 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 GUCA2BQ16661 112 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 OR2G6Q5TZ20 316 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 GHSRQ92847 366 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 FAM46BQ96A09 425 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 GALMQ96C23 342 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 PIPOXQ9P0Z9 390 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 AP4S1Q9Y587 144 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 A0A0G2JLM5 398 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 NUPR2A6NF83 97 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 RAB29O14966 203 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 SLC22A1O15245 554 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 CA11O75493 328 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 CD2P06729 351 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 MEDAGQ5VYS4 303 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRS-208ENST00000590509 PKHD1P08F94 4074 aa11.96□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 PDCD6O75340 191 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 GPX5O75715 221 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 RBBP9O75884 186 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 ALPLP05186 524 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 MC5RP33032 325 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 ETV1P50549 477 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF45Q02386 682 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 AWAT2Q6E213 333 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 OR10K2Q6IF99 312 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 LYG2Q86SG7 212 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 LAX1Q8IWV1 398 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 SVOPQ8N4V2 548 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC197Q8NCU1 140 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 CPEP16870 476 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 KIR2DS2P43631 304 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 C6orf201Q7Z4U5 140 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 APH1BQ8WW43 257 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 RNF5Q99942 180 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 KCNK15Q9H427 330 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 COA4Q9NYJ1 87 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 MSGN1A6NI15 193 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 C2orf70A6NJV1 201 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 FAM90A7PA6NKC0 464 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 PPP5D1E7EU14 171 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 EI24O14681 340 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 OGG1O15527 345 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 GLAP06280 429 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 FOLR2P14207 255 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 TNFRSF9Q07011 255 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 GPR176Q14439 515 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 TATDN3Q17R31 274 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 C5orf30Q96GV9 206 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms