RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516877.1

RNU6-1234P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1234, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1234P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SMIM9A6NGZ8 99 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C21orf140B9A014 251 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OR1I1O60431 355 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MPDU1O75352 247 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MYO1DO94832 1006 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GUCA1CO95843 209 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PPBPP02775 128 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 REG1AP05451 166 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RBM11P57052 281 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NDUFA5Q16718 116 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C9orf64Q5T6V5 341 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 AMTNQ6UX39 209 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C10orf107Q8IVU9 208 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF619Q8N2I2 560 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IMMP2LQ96T52 175 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CHP1Q99653 195 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CD209Q9NNX6 404 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RASL12Q9NYN1 266 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HHLA2Q9UM44 414 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 A0A0J9YW62 118 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ODAMA1E959 279 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LINC00862A6NCI5 91 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TLCD2A6NGC4 264 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HACD1B0YJ81 288 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 B4DEV8 164 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 UBE2L6O14933 153 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FADS1O60427 444 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NDUFB2O95178 105 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KRT16P08779 473 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TSPOP30536 169 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CA5AP35218 305 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CBX5P45973 191 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HSPA13P48723 471 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 BPIFB3P59826 476 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FGF12P61328 243 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PAFAH1B2P68402 229 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KCNJ8Q15842 424 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MIAQ16674 131 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HSDL1Q3SXM5 330 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CASC1Q6TDU7 716 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OOSP2Q86WS3 158 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TEX9Q8N6V9 391 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GALMQ96C23 342 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IMUPQ9GZP8 106 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C12orf4Q9NQ89 552 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PITPNC1Q9UKF7 332 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ITPR3Q14573 2671 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 STRCQ7RTU9 1775 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 A0A1B0GXF2 115 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 H3BSA7 217 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 H3BT86 120 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DFFAO00273 331 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAAHO00519 579 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GMFGO60234 142 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IFNW1P05000 195 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TACSTD2P09758 323 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 METTL15P1P0C7V9 234 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CD9P21926 228 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 STC1P52823 247 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GABARAPL2P60520 117 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RAB2AP61019 212 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RAB14P61106 215 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RHOAP61586 193 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GTF2BQ00403 316 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GNA12Q03113 381 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ACSM3Q53FZ2 586 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM27BQ5VT28 67 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TEX261Q6UWH6 196 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NELFCDQ8IXH7 590 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 UBE2J2Q8N2K1 259 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LINC00311Q8N616 119 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MITD1Q8WV92 249 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PSMF1Q92530 271 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 COA1Q9GZY4 146 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SLC38A1Q9H2H9 487 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RAB20Q9NX57 234 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TERF2IPQ9NYB0 399 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 VAPAQ9P0L0 249 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 BAIAP2Q9UQB8 552 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms