RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 OR51J1Q9H342 316 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 GNB4Q9HAV0 340 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 ZFP57Q9NU63 452 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 RDH8Q9NYR8 311 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 GAB2Q9UQC2 676 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 TRDCB7Z8K6 153 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 H7C2Y5 167 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 CCL24O00175 119 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 MFNGO00587 321 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 PDCD5O14737 125 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 BET1O15155 118 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 NDUFA3O95167 84 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 IGHG4P01861 327 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 HLA-DRB1P01911 266 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 IGF1P05019 195 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 PSMB8P28062 276 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 ECSCRQ19T08 205 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 LIN54Q6MZP7 749 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 REC114Q7Z4M0 266 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 ZNF383Q8NA42 475 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 NPBQ8NG41 125 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 OR51E2Q9H255 320 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 A3GALT2U3KPV4 340 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-213ENST00000494956 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 J3QRK9 145 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 RRHO14718 337 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 FABP7O15540 132 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 SOX15O60248 233 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 IGKV1-16P04430 117 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ELANEP08246 267 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 RNF152Q8N8N0 203 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 KIAA1456Q9P272 454 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PN81 502 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR5H14A6NHG9 310 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 M0R1X1 148 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ITGB1BP1O14713 200 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 IGLV1-40P01703 118 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR8U9P0C7N5 309 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 RAB6AP20340 208 aa8.26□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 PSMD7P51665 324 aa8.26□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 GNB1P62873 340 aa8.26□□□□□ -1.09
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NELFE-213ENST00000494956 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 MXD1Q05195 221 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ARFRP1Q13795 201 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 KIR2DS1Q14954 304 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 PLGLAQ15195 96 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR11H1Q8NG94 326 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR8U1Q8NH10 309 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 PTX4Q96A99 478 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 GON7Q9BXV9 100 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR2D2Q9H210 308 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 ZNF221Q9UK13 617 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 STUB1Q9UNE7 303 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 CA2P00918 260 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 TFAP2AP05549 437 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 GADD45AP24522 165 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 TGFBR1P36897 503 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 PSG5Q15238 335 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 NEDD8Q15843 81 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 CDNFQ49AH0 187 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-213ENST00000494956 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.25□□□□□ -1.09
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