RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 VAMP8Q9BV40 100 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-213ENST00000489895 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NISCH-213ENST00000489895 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NISCH-213ENST00000489895 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-213ENST00000489895 P2RX4Q99571 388 aa14.61□□□□□ -0.07
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NISCH-213ENST00000489895 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.61□□□□□ -0.07
NISCH-213ENST00000489895 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.6□□□□□ -0.07
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NISCH-213ENST00000489895 P2RY4P51582 365 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-213ENST00000489895 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.59□□□□□ -0.07
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NISCH-213ENST00000489895 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.59□□□□□ -0.07
NISCH-213ENST00000489895 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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NISCH-213ENST00000489895 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.58□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.58□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.58□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 C7orf77A4D0Y5 90 aa14.58□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 C9orf172C9J069 976 aa14.58□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.57□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 RBKSQ9H477 322 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 TMEM140Q9NV12 185 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 H3BQ15 152 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 NPBWR2P48146 333 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.57□□□□□ -0.08
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